Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms