Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Runx1Q03347 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms