Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col1a2Q01149 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms