Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms