Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms