Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms