Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms