Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Vbp1P61759 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vbp1P61759 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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