Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpdl3bP58242 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms