Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1P56183 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms