Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms