Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms