Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrbP28704 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrbP28704 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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