Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apex1P28352 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms