Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja4P28235 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms