Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ChgaP26339 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms