Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LynP25911 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LynP25911 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LynP25911 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LynP25911 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms