Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo2P25801 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo2P25801 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms