Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms