Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsta3P23591 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsta3P23591 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms