Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa4P06728 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa4P06728 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms