Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms