Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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