Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn20O55082 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms