Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1bO55017 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms