Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxO54751 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms