Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1aO35526 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx1aO35526 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms