Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna6O35345 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kpna6O35345 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms