Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Unc5cO08747 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms