Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Efna3O08545 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Efna3O08545 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Efna3O08545 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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