Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms