Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim15G3UY57 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim15G3UY57 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim15G3UY57 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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