Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc6F8VPZ5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms