Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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