Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms