Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3259D3YUK0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms