Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Samt1A2BED8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Samt1A2BED8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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