Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r2A2AMT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms