Protein–RNA interactions for Protein: A1L3P4

Slc9a6, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a6A1L3P4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a6A1L3P4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a6A1L3P4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms