Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPG7Q9UQ90 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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SPG7Q9UQ90 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SPG7Q9UQ90 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SPG7Q9UQ90 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SPG7Q9UQ90 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SPG7Q9UQ90 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SPG7Q9UQ90 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SPG7Q9UQ90 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SPG7Q9UQ90 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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