Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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HOXD1Q9GZZ0 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD1Q9GZZ0 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD1Q9GZZ0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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HOXD1Q9GZZ0 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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HOXD1Q9GZZ0 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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HOXD1Q9GZZ0 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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HOXD1Q9GZZ0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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