Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

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Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPN18Q99952 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN18Q99952 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN18Q99952 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPN18Q99952 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPN18Q99952 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN18Q99952 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPN18Q99952 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN18Q99952 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN18Q99952 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPN18Q99952 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPN18Q99952 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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PTPN18Q99952 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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PTPN18Q99952 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPN18Q99952 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN18Q99952 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN18Q99952 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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