Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ARXQ96QS3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARXQ96QS3 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARXQ96QS3 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ARXQ96QS3 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ARXQ96QS3 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ARXQ96QS3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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