Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHSY3Q70JA7 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHSY3Q70JA7 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHSY3Q70JA7 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHSY3Q70JA7 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHSY3Q70JA7 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHSY3Q70JA7 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHSY3Q70JA7 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHSY3Q70JA7 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHSY3Q70JA7 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHSY3Q70JA7 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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