Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ANKRD39Q53RE8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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