Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
RRN3P1Q2M238 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
RRN3P1Q2M238 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.7□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
RRN3P1Q2M238 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms