Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTN1Q16799 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTN1Q16799 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTN1Q16799 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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RTN1Q16799 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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RTN1Q16799 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
RTN1Q16799 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTN1Q16799 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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