Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HIF1AQ16665 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HIF1AQ16665 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HIF1AQ16665 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HIF1AQ16665 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HIF1AQ16665 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HIF1AQ16665 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HIF1AQ16665 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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