Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SNRNP35Q16560 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SNRNP35Q16560 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SNRNP35Q16560 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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