Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
DDB1Q16531 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDB1Q16531 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
DDB1Q16531 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDB1Q16531 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDB1Q16531 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms